税收信息化建设起步于1994年的税制改革。1994年，新税制出台后，增值税专用发票被犯罪分子盯上了。一些不法分子利用伪造、倒卖、虚开增值税专用发票等手段进行偷、逃、骗国家税款的违法犯罪活动，有的还相当猖獗，严重干扰了国家的税收秩序和经济秩序。为加强增值税专用发票管理，国务院领导要求，尽快实施金税工程建设。1994年3月底，金税工程试点工作正式启动。

    金税工程的全称是全国增值税专用发票计算机稽核网络系统。它是利用覆盖全国税务机关的计算机网络对增值税专用发票和企业纳税状况进行严密监控的一个系统，由一个网络和四个子系统组成。

    一个网络是指覆盖国家税务总局和各省、地市、区县税务局的计算机主干网。四个子系统包括增值税防伪税控开票子系统：其运用数字密码和电子信息存储技术，通过强化增值税专用发票的防伪功能，监控企业的销售收入，解决销项发票信息真实性问题。防伪税控认证子系统：税务征收机关利用其对增值税一般纳税人申请抵扣的增值税专用发票抵扣联进行解密还原认证。经认证无误的，才能作为纳税人合法的抵扣凭证。增值税稽核子系统：主要进行发票信息交叉稽核和申报信息稽核。发票协查信息管理子系统：它是对有疑问的和已证实虚开的增值税专用发票案件进行协查；认证子系统和稽核子系统发现有问题的专用发票，以及协查结果信息，通过税务系统计算机网络逐级传递，总局通过这一系统对协查工作实现组织、监控和管理。这四个子系统紧密相联，相互制约，构成了完整的增值税管理监控系统。

    金税工程一期、二期开通以来，已经成为提高我国税收效率的突破口，其作为增值税生命线、打击偷骗税“撒手锏”的作用初显成效。1998年以来，我国税收每年增收都超过了1000亿元。除经济增长、政策调整等原因外，主要得益于以金税工程为主要内容的税收信息化建设。据国家税务总局有关人士介绍，目前，金税工程防伪税控开票系统已推行约60万户。这60万户占全国一般纳税人总数120万户的1/2，用票量约占全部专用发票用量的70％。百万元版、十万元版和部分万元版专用发票已取消手工开具，改用金税工程防伪税控开票系统开具。对一些不需要开具大面额发票的企业改为开具较小面额版式的专用发票，使开具大面额发票的企业户数由12000户减少为6800户，减少了发票犯罪的隐患，为加强增值税征管创造了有利条件。

    金税工程防伪税控认证系统运行良好，利用假票、大头小尾票骗抵税款的违法活动逐步得到遏制。今年以来，防伪税控认证系统对企业申报扣税的进项发票（防伪税控系统开具的）进行认证，累计认证进项发票6938万份，发现涉嫌违规的发票5460份，占全部认证的比例为0.008％；发现涉嫌违规发票从1月份的1367张降到7月份的429张，占认证发票总量的比例逐月降低，由1月份的0.012％降至7月份的0.004％。

    增值税计算机交叉稽核系统已在全国3835个区县以上税务机关如期联网运行，共采集存根联发票8916万份，1—7月份全国存根联采集率均在99.9％以上，极大地促进了企业依法申报纳税。通过稽核，前7月发现涉嫌违规发票46706份，占全部稽核发票抵扣联的比例为0.067％。

    此外，今年以来，税务机关通过认证和交叉稽核及时发现问题，并迅速组织了协查，加快了发票案件查处速度，提高了稽查工作效率。1—7月，全国稽核系统移交协查发票52166份。