增值税防伪税控办税流程包括以下流程： 

增值税防伪税控企业的认定指南

     一、认定流程
     防伪税控培训→提供证件、资料→全程服务受理台受理→相应国税局承办岗审核、认定→全程服务受理台→纳税人
     二、需提供的证件、资料
     1、《防伪税控企业认定登记表》；
     2、申请百万元未用发票的还需提供营业执照复印件，一般纳税人认定申请表复印件。
     三、 注意事项
     1、企业必须先参加防伪税控培训．
     2、企业必须取得操作员证书。 

增值税专用发票防伪税控发行指南

     一、增值税专用发票防伪税控发行流程
     外税局、各县（市）区国税局增值税专用发票防伪税控发行岗发行→纳税人
     二、需提供的资料
    《防伪税控企业认定登记表》
     三、注意事项
     1、企业必须先取得增值税专用发票防伪税控认定。
     2、必须购买好相应的金税设备。
 
防伪税控发票抵扣联认证指南
    一、防伪税控发票抵扣联认证流程 
    防伪税控发票抵扣联认证相关材料→金税认证窗口认证 
    二、需提供的资料 
    1、防伪税控抵扣联发票原件； 
    2、税务登记证副本。
    三、注意事项
    1、当月（申报时间）需申报抵扣的防伪税控发票抵扣联必须在上月月底前（即申报所属时间当月月底前）进行认证，方能申报抵扣，特殊情况需申报抵扣的须相应国税局批准。
    2、防伪税控发票抵扣联认证必须在发票开具时间的次日起的六个月内（红字发票二个月内）进行认证，超期不能认证。
    3、防伪税控发票抵扣联认证数量多的可预先约定认证时间。
    4、已认证的防伪税控发票抵扣联要加盖认证专用章并取得认证结果通知书。
    5、丢失防伪税控发票抵扣联可凭防伪税控发票开具方国税局已抄税证在规定时间内进行认证。
 
防伪税控企业抄税指南
    一、防伪税控企业抄税流程
    防伪税控企业抄税相关材料→金税报税窗口报税
    二、需提供的资料
    1、IC卡和软盘、《月份税务资料统计表》或《金税卡资料统计表》；
    2、企业抄税情况反馈单；
    3、增值税专用发票使用明细表。
    三、注意事项
    1、防伪税控企业在申报之前必须先进行防伪税控企业抄税。
    2、本月有进行技术维护无法正常抄税的必须带存根联到税务机关进行扫描录入。 

防伪税控无法认证、识别码和发票代码号码认证不符
需开具无法认证、认证不符专用发票重新开具证明指南
    一、防伪税控认证无法认证、认证不符专用发票重新开具证明流程
    防伪税控认证时→金税认证窗口开具
    二、需提供的资料
    防伪税控无法认证、识别码认证不符和发票代码号码认证不符防伪税控抵扣联发票原件。
    三、注意事项
    防伪税控认证时发现无法认证、识别码认证不符和发票代码号码认证不符应当场取得证明，用于重新开具防伪税控发票。